Claude fant 17 proteinbindere mot skorpiongift blant 211 lab-testede design
onsdag 21. oktober · KI-generert · Kilde: Anthropic
Les Anthropics nye forsøk som et mål på hva en langkjørende agent klarer i biologi i dag: 17 av 211 lab-testede proteindesign fra Claude bandt seg til skorpiongift.
Skorpioner stikker minst 1,2 millioner mennesker i året og dreper over 3 250, mest barn i områder med dårlig tilgang på helsehjelp. Motgift lages fortsatt ved å immunisere hester med gift melket fra tusenvis av skorpioner, og det tar måneder. Det var utgangspunktet da Anthropic, sammen med investeringsanalysefirmaet Citrini Research, ba en intern forskningsmodell i Claude Science designe minibindere, små proteiner som fester seg til et mål, mot fem nervegifter fra skorpioner i Mexico, Brasil, Nord-Afrika og Midtøsten. Anthropic publiserte resultatene 20. oktober.
Modellen jobbet i 64 timer, hovedsakelig autonomt, styrt av én startprompt og fire oppfølgingsprompter. Den hentet giftstrukturer fra Protein Data Bank og AlphaFold-databasen, satte egne kvalitetsterskler og brukte 12 designverktøy til å generere 318 484 design. Deretter foldet den 553 052 par av design og gift sammen, valgte ut 180 og sendte sekvensene på e-post til Twist Bioscience. Kampanjen brukte i størrelsesorden 10 000 GPU-timer, og teamet la til 31 design med Claudes hjelp.
Adaptyv Bio og Twist Bioscience testet alle 211 i lab. 17 oppfylte kravene, alle mot én enkelt gift. Ingen av de 151 designene som skulle treffe flere gifter samtidig, bandt seg til mer enn én. Blant de 60 enkeltgift-designene var treffraten 18 prosent, som Anthropic selv kaller vanlig for proteindesign. De to sterkeste, Cn2-B1 og Cn2-B2, bandt med affinitet i det ensifrede nanomolare området og ser ut til å feste seg på samme sted som et antistoff som nøytraliserer giften i mus.
«Selve bindingen er ikke lenger den største flaskehalsen» — Susana Vázquez Torres, postdoktor ved CNIO i Madrid
Anthropic har ikke testet om binderne nøytraliserer gift i celler eller beskytter dyr, og hevder ikke å ha laget en motgift. Alle 211 design og måledataene er frigitt. For deg som bygger agenter er oppsettet det mest interessante: en modell som kjører i nesten tre døgn med verktøykall og egne terskler, og som bare fikk fire nye instrukser underveis.